Un equipo del CONICET creó un software que permite secuenciar y ensamblar el complejo genoma del parásito Trypanosoma cruzi, causante de la enfermedad de Chagas.
Un equipo de científicos del CONICET desarrolló una herramienta bioinformática diseñada para secuenciar, ensamblar y analizar el genoma del Trypanosoma cruzi, el parásito que causa la enfermedad de Chagas.
La enfermedad de Chagas afecta a más de seis millones de personas en el mundo, según datos de la Organización Mundial de la Salud. Se transmite principalmente por la vinchuca y puede generar complicaciones cardíacas y digestivas crónicas.
El genoma del Trypanosoma cruzi presenta características que dificultan su análisis: es altamente repetitivo, tiene una alta tasa de variación cromosómica y contiene familias multigénicas numerosas. Los ensambladores convencionales de ADN no lograban procesarlo correctamente, lo que generaba inconsistencias en bases de datos internacionales.
El grupo de investigación del CONICET diseñó un algoritmo bioinformático capaz de procesar datos masivos de secuenciación de nueva generación. El software integra modelos matemáticos que ordenan las secuencias repetitivas y reconstruyen la arquitectura cromosómica del parásito.
Según el comunicado oficial del CONICET, la plataforma permite realizar estudios de genómica comparativa entre distintas cepas del parásito. La herramienta cruza información genómica y transcriptómica mediante un flujo de trabajo de código abierto.
El sistema mapea los genes que codifican proteínas de superficie del parásito, lo que ayuda a identificar los mecanismos que utiliza para evadir el sistema inmune humano. Los investigadores pueden localizar blancos moleculares con mayor rapidez, lo que reduce los tiempos y costos de ensayo en laboratorio.
Actualmente, los únicos dos medicamentos disponibles para tratar el Chagas —benznidazol y nifurtimox— tienen eficacia limitada en la fase crónica de la infección y pueden generar efectos adversos en pacientes adultos.